Ennen maksutarjoajan valitsemista kannattaa perehtyä palveluiden ominaisuuksiin ja hinnastoihin. Palveluiden hinnat voivat vaihdella. Erityisen ratkaisevaa on se, maksetaanko palvelusta vain kuukausimaksua vai veloittaako maksupalvelu maksun jokaisesta transaktiosta.. Jos verkkokauppa tekee todella huomattavaa myyntiä, maksutarjoajien kanssa on mahdollista neuvotella erillisistä sopimuksista.
Tärkeintä on, että verkkokauppa tarjoaa asiakkaille useampia vaihtoehtoisia maksutapoja ja että ainakin yleisimmät luottokortit ja verkkopankit ovat tuettuja. Nämä vaihtoehdot löytyvät yleisimmistä kokonaispakettia tarjoavista maksunvälityspalveluista. Maksutapoihin voi lisätä myös laskun ja postiennakon, jos arvelee kaupan potentiaalisen asiakasryhmän suosivan näitä maksutapoina. Laskuissa kauppiaan tulee ottaa huomioon, että ne voivat toisinaan edellyttää perintätoimiin ryhtymistä, toisin kuin maksuhetkellä vahvistettavissa verkkomaksuissa. Tulevaisuudessa kauppaan voidaan myös lisätä maksutapoja asiakkaiden toivomusten mukaan.